吴昌期，1936年1月生，江西南昌人。1954年毕业于杭州土木工程学校(交通部南京高等交通专科学校前身，2000年交专并入东南大学)。
吴昌期，曾任安徽省交通厅设计院港航设计室副主任、省公路局设计规划室副主任、省交通纵队大桥设计组组长、省07403工程指挥部副指挥、省交通科研所总工程师，1980年升任安徽省交通厅副厅长、1981年任副厅长兼党组副书记。
1983年吴昌期奉命调任西藏自治区人民政府副主席、党组成员。
1986年吴昌期从西藏调回安徽省任省经济文化发展中心党组书记(副省级)。
1987年任安徽省经济委员会主任、党组书记、省政府党组成员(副省级)。
1988年吴昌期任安徽省人民政府副省长、党组成员。
1993年至今任安徽省人大常委会副主任、党组副书记。
吴昌期还是安徽省第六届、第八届、第九届的人大代表，中共十二大代表。
吴昌期，还是中国科技大学和安徽师范大学的兼职教授。